过，有
可以肯定，刘铭传治台数年，并非完全以“派系”画线，以“门
”取人。比如，
对陈鸣志
任用就很说明问题。陈鸣志系湘人，官居江苏候补
。刘璈革职后，刘铭传提议用时，有人在耳边嘀咕说：“湘人门重，台南将吏皆湘人，陈亦湘人，恐对公利。”
刘铭传看到了陈鸣志能力，
持使用，后来陈鸣志在任
果然
得错，成绩显著，广受
评。光绪十
年（1887年）
月，刘铭传还专门打报告为陈请赏，称“自署任以来，整顿营务吏治，惮劳怨，于军务、洋务尤为熟悉，为员
可多得之员”。
据史料记载，刘铭传主台后，查办官员在少数。镇海前军记名提督方
发剋扣饷银，勾结知县陈海贩运烟土，听任
，以致营务废弛；镇海前军右营
兵桂占彪“减发银两，扣发存饷”，紊
营规，实属
法纪；游击郑有勤、守备张安珍、候补知县徐石麒、县丞凌云等“侵冒饷银”“怂恿为
”等等……对于
些违法违纪官员，论何人，所任何职，刘铭传律严惩贷，绝姑息。
然而，对于样批评也有同看法。或许，刘铭传对刘璈
置掺杂了派系因素，
“辅佐”假设也只
假设而已，或许只能厢
愿。
刘铭传抚台后，
刘直和。刘璈依仗左宗棠等湘系员支持，多次纠弹刘铭传和淮系官吏，刘铭传对此痛恨已。法战事结束，便腾
手来拿刘璈开刀了，先后查问题共十八条。如，利用手职权常年吃空饷；虚支
款、扣存冒银、任意冒销，可谓“贪污狡诈，劣迹多端”等等，奏请朝廷将其革职。久，朝廷派员
查，基本属实。光绪十年（1885年）十月间，清廷连续旨，认定“该革(刘璈)以监司员理营务，辄敢虚支款，任意冒销。律以监守自盗，罪无可辞”，决定以斩监候(即死缓)，后改为
放黑龙江，并对其所有家产(包括任所、原籍) 并查抄。
刘铭传在台湾掀起反腐风暴来势凶猛，时间官场震慑，风气变。也有人指责刘铭传，说借整顿吏治清除异己。特别刘璈案，众说纷纭。台湾史学家连横说过，刘璈有“经国之才”，如果刘铭传将其治罪，而用来辅佐自己，则刘铭传治北，刘璈驻南，以此经理台疆，南北俱举，必有可观。可惜，刘铭传能容。连横为此
叹：“非才之难，而所以用之者实难，有以哉!”
刘铭传新政充满了创新
神，“于举国未为之日，独先为之”。在力推动之，台湾很快从个半开化府跃成为“全清国最
步省”。曾任国海关税务司
士称刘个“伟巡抚”，并说无论在行政革新，还在工业改革或改革尝试，刘铭传都走在了全国前列。随着时间推移，人们对评价也越来越
。有人把称作“伟
国者”“台湾现代化之父”。连横先
称其功业，“足与台湾朽矣”。
在办理此案，对于刘璈同伙和党羽，刘铭传也并行了清除。原提督登玉被从重“发往军台效力赎罪”；原同知胡培滋被革职，驱除回籍，“永叙用”；原副将张福胜、原知府刘济南等也“并革职”。
在吏治整顿，对于些为非作歹，拒听命官员，刘铭传也该革革，该杀杀，该撤撤，该办办。宜兰县令王家驹公然勒索富绅周家芳，为
周家就范，还把周家芳兄弟抓了起来。周家向刘铭传告状，刘令王家驹放人，可王拒听命。刘铭传派人查清况后，得知王家驹在办理捐款收受贿赂，随意增减甚至免除数额，存在“诸多公”。于立即弹劾王家驹，将其革职查办。
，多于湘系和淮系。文官知县以，非湘即淮。刘铭传主台前，台湾刘璈统天；刘铭传任后，淮系后来居。从势力范围看，淮系控制着台北、台带，而台南则为湘系所把持。刘璈湘系在台湾
面人
，此人为官十余载，其势力盘
错节，布满要津。应该说，刘璈主台多年，对台湾防卫和建设亦有功劳。据《台湾通史》记，光绪十年(1885年)月，孤
攻台南，托英国领事约刘璈来船谈判，左右都劝说能去，刘璈答曰：去以为
怕，咄，岂畏死之人？临行前，指示炮台，如遇警即开炮，要考虑在敌船边。孤置酒相迎，言谈威胁说，台南城池小，兵力弱，将以何战？刘璈回答说：“然城，土也，兵，纸也，而民心，铁也。”孤默然，法舰亦去。
刘铭传抚台六年，殚竭虑，勇于任事，其公认
功绩有办防、抚番、清赋、新政和调整行政区域，而且每项功绩都可载
史册。特别推行新政，如电线、电报、电力、邮政、
船、学堂等系列新兴事业，都
有开创
，有目共睹。当时，陆铁路还禁区，却率先修了条基隆至台北铁路(国人自己修建最早铁路)。此外，还有两条海底电缆，条由沪尾海
至福州石川，全
百十七公里；条由安平海至澎湖妈
港，全九十八公里。